序列组装程序

一套广为应用的并行分子动力学模拟软件，是主要用来研究大分子体系的高性能分子模拟软件

一款很经典的构建进化树的软件

一款商业软件,但是如果只是科研用途的话,可以直接从其网站上下载到编译好的程序

用于拼接短序列组装

分子动力学相关的一些计算和模拟工作

欧洲分子生物学开放软件包,一个开源的序列分析软件包

一款利用最大似然法对DNA或蛋白质序列进行系统发育分析的软件包

是一种快速灵敏的比对程序，用于将下一代测序读数（包括DNA和RNA）映射到人类基因组群体（以及单个参考基因组）

可以拼接来自多个平台的测序数据

基于隐马尔可夫模型,用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包,它的一般用途是识别同源蛋白或核苷酸序列和进行序列比对

一种渐进的多序列比对方法,先将多个序列两两比对构建距离矩阵,反应序列之间两两关系

通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能

用于大型和复杂宏基因组学NGS读取的单节点汇编程序，例如土壤

并行ClustalW